AfterEffectsのプラグインで FreeForm というのがあります。CS5で製品にバンドルされた! と思ったらなんとCS5/5.5限定だったみたいで今は消えているのですね。残念。これを使うと旗をなびかせるのとか簡単にできたのですが。
https://www.flashbackj.com/aescripts/freeform_pro/
2万8000円か…うーむ。
仕方ない、Cinema 4Dでやるかーと思って調べたらクロスはStudioのみ搭載でした。トホホ。
http://www.aanda.co.jp/products/cinema4d/list.html
(2018/7/16追記)
Broadcastでも「風」デフォーマで簡単にできました!!